肥料是用以调节植物与土壤间养分供需矛盾，为植物生长提供良好关系的物料。

肥料一般分为直接肥料和间接肥料。直接肥料是含有植物必需的营养元素，对植物具有直接营养作用的一类肥料。直接肥料又可分为有机肥料与无机肥料两大类。间接肥料系用以调节土壤酸碱度，改良土壤结构，改善土壤理化性质、生物化学性质或调节植物生长发育为主要功效的肥料，如微生物肥料、石灰等。

微生物肥料是指由一种或数种有益微生物、培养基质和添加物（载体）培制而成的生物性肥料，称菌肥或菌剂，是一种间接性肥料。有一些人将微生物肥料的作用无限夸大，甚至宣传施用某种“微生物肥料”一次，就可不再使用化肥或其它肥料，这是完全没有科学根据，纯属一种误导。一方面至今还没有从植物营养学的角度，去证明微生物肥料施一次即可不再施化肥的证据；另一方面也没有用规范的田间试验报告，来证明其取代化肥的结果。微生物肥料氮磷钾养分含量很低，将其施入土壤中后，微生物会将土壤中原来不能被作物直接吸收利用的部分无效态养分，活化成作物根系可以直接吸收的有效态养分，但是这些微生物的活动时间和能力是有限，作物吸收的大部分养分，还得靠化肥补充，微生物肥料完全取代化肥的说法是站不住脚的。